Nacida en Almansa, María José Belotto estudió en el Real Conservatorio Superior de Música de Madrid y en la Hochschule für Musik Hanns Eisler de Berlín, donde realizó estudios de Orchester-Diplom y Pedagogía bajo la tutela de Benoît Fromanger, Eberhard Grünenthal y Pirmin Grehl, completando su formación con cursos y clases magistrales impartidos por reconocidos flautistas como Emmanuel Pahud, Jelka Weber, Andrea Lieberknecht, Jaime Martín, Paul-Edmund Davies, Riccardo Ghiani, Christine Fassbender y Magdalena Martínez, entre otros.

Fue finalista para la plaza de Piccolo Solista de la Orquesta Sinfónica de Madrid, titular del Teatro Real, desempeñando dicho puesto durante la temporada 2017/18. Entre 2009 y 2010 formó parte de la Orquesta del Palau de les Arts Reina Sofía de Valencia como flauta y piccolo, trabajando bajo la dirección de Lorin Maazel y Zubin Mehta. Colabora habitualmente con destacadas formaciones españolas, entre ellas Orquesta Sinfónica de Madrid, la Orquesta Sinfónica de RTVE, la Orquesta Filarmónica de Gran Canaria, la Real Orquesta Sinfónica de Sevilla, la Orquesta Reino de Aragón, la Orquesta de Valencia y la Orquesta Sinfónica de Galicia, actuando bajo la dirección de maestros como Ivor Bolton, Josep Pons, Juanjo Mena, Nicola Luisotti, Walter Weller, Miguel Ángel Gómez-Martínez o Víctor Pablo Pérez. Entre 2003 y 2006 fue miembro de la Joven Orquesta Nacional de España (JONDE).

Su interés por la música de cámara la ha llevado a participar en numerosas agrupaciones, como el Quinteto Hyperión o la Sociedad Filarmónica Madrid-Berlín, con la que ha actuado en escenarios como el Auditorio Nacional de Música de Madrid, el Konzerthaus de Berlín o el Teatro Gran Rex de Buenos Aires, entre otros. En 2006 obtuvo el Primer Premio en el Concurso de Interpretación de Música Contemporánea Hanns Eisler. Desde 2011 forma dúo estable con el guitarrista Gonzalo Noqué, ofreciendo conciertos en diversas salas y ciclos, entre ellos la Fundación Juan March de Madrid. Su discografía incluye la grabación Ferdinand Rebay: Flute and Guitar Sonatas (Brilliant Classics, 2012), realizada junto al guitarrista Gonzalo Noqué.

Compagina su actividad concertística con la enseñanza. Ha sido profesora de flauta travesera para la Junta de Andalucía y actualmente es profesora de Repertorio Orquestal en el Conservatorio Superior de Música de Castilla-La Mancha.